El Ciclo Internado Rotatorio es el último ciclo de la carrera, de duración anual, de actividad práctica pre profesional supervisada. La Clínica Médica B  tiene 12 a 16 cargos de Practicantes Internos, que realizan rotaciones trimestrales. Durante su rotación en la Clínica, realizan actividad clínica de sala de medicina de cuidados moderados, interconsulta de Medicina Interna en pacientes quirúrgicos y embarazadas de alto riesgo y guardia en el Dpto. de Emergencia del Hospital de Clínicas. Los Internos están plenamente integrados a los equipos de sala y piso y participan de rounds, ateneos del servicio

Como preparación para la prueba de ingreso al Internado, docentes de Grado 2 y 3 de la Clínica Médica B realizan los denominados “Encares” junto con otros servicios. Se trata de instancias de discusión de casos clínicos con preguntas guía.